MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 genome

Total Repeats: 68571

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021081	CACC	2	8	244405	244412	25 %	0 %	0 %	75 %	482881890
5502	NC_021081	CCTGC	2	10	244415	244424	0 %	20 %	20 %	60 %	482881890
5503	NC_021081	CCG	2	6	244431	244436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881890
5504	NC_021081	GCC	2	6	244515	244520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881891
5505	NC_021081	GCT	3	9	244567	244575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881891
5506	NC_021081	TGG	3	9	244593	244601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881891
5507	NC_021081	TGC	2	6	244668	244673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881891
5508	NC_021081	CGG	2	6	244690	244695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881891
5509	NC_021081	GCA	2	6	244773	244778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881891
5510	NC_021081	GGA	2	6	244783	244788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881891
5511	NC_021081	GAA	2	6	244826	244831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881891
5512	NC_021081	CG	3	6	244924	244929	0 %	0 %	50 %	50 %	482881891
5513	NC_021081	GCT	2	6	244973	244978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881891
5514	NC_021081	GCCCAG	2	12	245015	245026	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	482881891
5515	NC_021081	GCC	2	6	245037	245042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881891
5516	NC_021081	CGGG	2	8	245099	245106	0 %	0 %	75 %	25 %	482881891
5517	NC_021081	GCCGAG	2	12	245216	245227	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	482881891
5518	NC_021081	ACA	2	6	245310	245315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482881891
5519	NC_021081	GTT	2	6	245387	245392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881891
5520	NC_021081	TTG	2	6	245418	245423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881891
5521	NC_021081	G	6	6	245466	245471	0 %	0 %	100 %	0 %	482881891
5522	NC_021081	GAT	2	6	245484	245489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881891
5523	NC_021081	CTC	2	6	245551	245556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881892
5524	NC_021081	GGT	2	6	245565	245570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881892
5525	NC_021081	TAC	2	6	245662	245667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881892
5526	NC_021081	CTG	2	6	245693	245698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881892
5527	NC_021081	GCA	2	6	245745	245750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881892
5528	NC_021081	GCT	2	6	245826	245831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881892
5529	NC_021081	GGTG	2	8	245832	245839	0 %	25 %	75 %	0 %	482881892
5530	NC_021081	A	6	6	246002	246007	100 %	0 %	0 %	0 %	482881892
5531	NC_021081	AGG	2	6	246067	246072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881893
5532	NC_021081	GGT	2	6	246119	246124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881893
5533	NC_021081	TCC	2	6	246212	246217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881893
5534	NC_021081	C	6	6	246216	246221	0 %	0 %	0 %	100 %	482881893
5535	NC_021081	ATG	2	6	246291	246296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_021081	GCA	2	6	246434	246439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5537	NC_021081	GAC	2	6	246528	246533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_021081	CCG	2	6	246559	246564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5539	NC_021081	TGG	2	6	246576	246581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_021081	G	6	6	246605	246610	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_021081	AGTT	2	8	246632	246639	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_021081	T	6	6	246638	246643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_021081	AAT	2	6	246670	246675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_021081	CTATAG	2	12	246762	246773	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5545	NC_021081	CTA	2	6	246802	246807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_021081	CCA	2	6	246893	246898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5547	NC_021081	T	8	8	246969	246976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_021081	GTT	2	6	246998	247003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_021081	T	7	7	247002	247008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_021081	ATG	2	6	247046	247051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_021081	TCA	2	6	247120	247125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5552	NC_021081	GAA	2	6	247166	247171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_021081	AT	3	6	247308	247313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_021081	TG	3	6	247341	247346	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_021081	TGT	2	6	247371	247376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_021081	ATG	2	6	247424	247429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_021081	ATT	2	6	247480	247485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_021081	GTG	2	6	247509	247514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_021081	GCTA	2	8	247578	247585	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5560	NC_021081	CTCC	2	8	247612	247619	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5561	NC_021081	AG	3	6	247703	247708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_021081	CGG	2	6	247715	247720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_021081	CTG	2	6	247805	247810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5564	NC_021081	G	6	6	247824	247829	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_021081	GGTA	2	8	247895	247902	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_021081	CCTT	2	8	247904	247911	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5567	NC_021081	TGG	2	6	247922	247927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_021081	GCG	2	6	247982	247987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5569	NC_021081	AGGG	2	8	248019	248026	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_021081	GGT	2	6	248028	248033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_021081	CGG	2	6	248039	248044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5572	NC_021081	ATG	2	6	248186	248191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_021081	T	6	6	248201	248206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_021081	CAA	2	6	248207	248212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_021081	AAC	2	6	248291	248296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5576	NC_021081	GAT	2	6	248314	248319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_021081	GGCT	2	8	248367	248374	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5578	NC_021081	TTG	2	6	248378	248383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_021081	AGA	2	6	248396	248401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_021081	TTTC	2	8	248420	248427	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5581	NC_021081	T	6	6	248447	248452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_021081	T	7	7	248468	248474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_021081	AT	3	6	248646	248651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_021081	TATT	2	8	248701	248708	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_021081	TGCTT	2	10	248730	248739	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5586	NC_021081	TAG	2	6	248803	248808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_021081	TGC	2	6	248891	248896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5588	NC_021081	AGG	2	6	248979	248984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_021081	TAC	2	6	249021	249026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5590	NC_021081	T	6	6	249027	249032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_021081	GT	3	6	249035	249040	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_021081	GCTA	2	8	249046	249053	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5593	NC_021081	T	7	7	249213	249219	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_021081	CGG	2	6	249243	249248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5595	NC_021081	GCTA	2	8	249282	249289	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5596	NC_021081	ACA	2	6	249290	249295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5597	NC_021081	GTG	3	9	249390	249398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881894
5598	NC_021081	CGC	2	6	249459	249464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881894
5599	NC_021081	CCG	2	6	249478	249483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881894
5600	NC_021081	ACG	2	6	249521	249526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881894
5601	NC_021081	CTTT	2	8	249566	249573	0 %	75 %	0 %	25 %	482881894
5602	NC_021081	ACG	2	6	249604	249609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881894
5603	NC_021081	GCA	2	6	249614	249619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881894
5604	NC_021081	GCA	2	6	249632	249637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881894
5605	NC_021081	CGG	2	6	249653	249658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881894
5606	NC_021081	TG	3	6	249732	249737	0 %	50 %	50 %	0 %	482881894
5607	NC_021081	GCT	2	6	249752	249757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881894
5608	NC_021081	GCT	2	6	249830	249835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881894
5609	NC_021081	CTAC	2	8	249929	249936	25 %	25 %	0 %	50 %	482881894
5610	NC_021081	TTG	2	6	249981	249986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881894
5611	NC_021081	TGGC	2	8	250107	250114	0 %	25 %	50 %	25 %	482881894
5612	NC_021081	CCA	2	6	250122	250127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881894
5613	NC_021081	TGG	2	6	250213	250218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881894
5614	NC_021081	GTT	2	6	250220	250225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881894
5615	NC_021081	ACC	2	6	250240	250245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881894
5616	NC_021081	T	6	6	250398	250403	0 %	100 %	0 %	0 %	482881894
5617	NC_021081	GCA	2	6	250446	250451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881894
5618	NC_021081	AAG	2	6	250483	250488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881894
5619	NC_021081	TCG	2	6	250555	250560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881894
5620	NC_021081	CCCTA	2	10	250567	250576	20 %	20 %	0 %	60 %	482881894
5621	NC_021081	GCG	2	6	250642	250647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881894
5622	NC_021081	GTTG	2	8	250778	250785	0 %	50 %	50 %	0 %	482881894
5623	NC_021081	AGG	2	6	250786	250791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881894
5624	NC_021081	GAC	2	6	250827	250832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881894
5625	NC_021081	GGT	2	6	250904	250909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881894
5626	NC_021081	CTT	2	6	251041	251046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881894
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5628	NC_021081	AT	3	6	251267	251272	50 %	50 %	0 %	0 %	482881894
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5865	NC_021081	GCTG	2	8	262172	262179	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5866	NC_021081	GGCCTC	2	12	262332	262343	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	482881903
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5870	NC_021081	GGCCA	2	10	262545	262554	20 %	0 %	40 %	40 %	482881903
5871	NC_021081	CTG	2	6	262561	262566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881903
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5873	NC_021081	TGC	2	6	262711	262716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881903
5874	NC_021081	CGGG	2	8	262777	262784	0 %	0 %	75 %	25 %	482881903
5875	NC_021081	TGC	2	6	262802	262807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881903
5876	NC_021081	GGC	2	6	262812	262817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881903
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5882	NC_021081	GCA	3	9	263054	263062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881903
5883	NC_021081	TA	3	6	263129	263134	50 %	50 %	0 %	0 %	482881903
5884	NC_021081	ACCG	2	8	263185	263192	25 %	0 %	25 %	50 %	482881903
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5888	NC_021081	GAGGT	2	10	263317	263326	20 %	20 %	60 %	0 %	482881903
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5996	NC_021081	GCCGGG	2	12	268448	268459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881908
5997	NC_021081	ATG	2	6	268470	268475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881908
5998	NC_021081	GCG	2	6	268494	268499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881908
5999	NC_021081	AGG	2	6	268539	268544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881908
6000	NC_021081	CGG	2	6	268609	268614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881908

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